La oficina de Registro se fundó el 1 de enero de 1968 conformada por la Sección de Calificaciones y Matrícula, siendo el primer jefe el Licdo. Adolfo León Gómez. En el año de 1978 se creó la Sección de Archivo. En el año de 1998 se creó la Sección de Tecnología y en el 2009 comenzó a funcionar la sección de Asesoría y Atención.
A través de los años la Oficina de Registro ha experimentado diferentes cambios, pasando de la modalidad de procesos manuales a procesos en línea en el año 2004, entre ellos los procesos de matrícula e ingreso de calificaciones.